近年来，我院承担了许多重要的国内外科研项目，获得了科研经费超过800万元。先后承担了国家自然科学基金项目6个，国家“九五”科技攻关重中之重子项目1个，国际合作项目3个，国家“863”子项目1个，国家教育部项目3个，霍英东教育基金（研究类）项目1个，以及福建省自然科学基金重点、福建省科技重大、重点项目等。先后获省科技进步二等奖2项，省科技进步三等奖2项，获得授权专利9项。近五年来先后出版专著或教材7部，近三年发表学术论文170多篇，被SCI、EI收录53篇次。

在承担国家和省级的各种项目同时，我院还积极为地方经济建设服务，承担了许多地方政府和大型企业委托的项目，许多成果为地方的环境保护和资源利用做出了很大的贡献。